Tsukino Usagi továbbra is küzd azzal, hogy összeegyeztesse hétköznapi, középiskolás lány életét azzal, hogy egyszersmind Sailor Moonkén megvédje a világot. Barátaival ezúttal egy új ellenséggel néz szembe, amely befészkelte magát a patináns Mugen Magániskola falai közé és démonokká változtatja az ott tanuló lányokat. A lányok ezen kívül három titokzatos személlyel is ismeretséget kötnek. Ők pedig Tennoh Haruka, a híres autóversenyző, Kaioh Michiru, a tehetséges hegedűművész, valamint Tomoe Hotaru, egy rejtélyes lány, akinek furcsa betegsége van.
A lányok ezen kívül, ahogy a Mugen Magániskola után nyomoznak, belebotlanak három új senshibe, akik a maguk útját járják és nem akarnak közösködni Usagiékkal. Azonban lehetséges, hogy muszáj lesz együttműködniük, hogy legyőzzék az új ellenséget, Pharaoh 90-et.